Японские специалисты использовали мультимодальный интегрированный подход для разработки потенциальных новых методов лечения болезни Чагаса, объединив принципы структурного дизайна препаратов с лабораторными методами тестирования и рентгеновской кристаллографией.
Исследование было проведено сотрудниками Токийского технологического института и Университета Нагасаки.
Большинство препаратов, используемых для лечения болезни Чагаса, были разработаны еще в 60-х и вызывают серьезные побочные эффекты. Подход исследователей упростил поиск новых лекарств. Суперкомпьютеры указали на целевой белок возбудителя болезни – спермидинсинтазу (SpdSyn). Специфические структурные черты и свойства указали на важную роль протеина в выживании различных видов трипаносом. Подавление белка может стать потенциальным механизмом в борьбе T. cruzi, паразитом, провоцирующим болезнь Чагаса.
Исследователи определили потенциальных кандидатов на ингибиторы спермидинсинтазы путем моделирования стыковки. Структурная методика дизайна лекарств использует трехмерную симуляцию для вычислительного присоединения компонентов препаратов к белку. Авторы успешно обнаружили 4 похожих на медикаменты субстанции, являвшихся виртуальными «парами» протеина. Затем их подвергли лабораторным тестам, проверяя активность подавления SpdSyn, сравнив результаты с положительной контрольной пробой. Все препараты взаимодействовали с выбранными активными центрами с помощью одной аминокислоты – Asp171. Дополнительно молекулярная симуляция предположила наличие других участков связывания, не предсказанных моделированием стыковки.
0 комментариев