Вторник, 25 апреля 2017 года
ГЛАВНОЕ » Наука » Новая платформа упрощает программирование живых клеток

Новая платформа упрощает программирование живых клеток

Команда исследователей Бостонского университета разработала платформу, позволяющую программировать клетки млекопитающих как генетические цепи, упрощая тем самым процесс.

Результаты работы опубликованы доцентом Уилсоном Вонгом в Nature Biotechnology.

«Основная проблема синтетических биологов – разработка стратегий, заставляющих клетки выполнять конкретные задачи, — отметил специалист. – С этими схемами мы использовали абсолютно новый подход, создав основу для будущих исследований, нацеленную на специфические типы клеток и провоцирующую их на определенные действия».

В платформе Вонга используются рекомбиназы ДНК – ферменты, вырезающие и вставляющие последовательности ДНК. Такой подход обеспечивает более прицельные манипуляции клетками и их поведением. Платформа получила название BLADE («Булева логика и арифметика через иссечение ДНК»). Используя основы компьютерного программирования, она позволяет исследователям применять различные сигналы в одном упрощенном устройстве, контролируя поведение обрабатываемых клеток.

«Идея заключалась в создании простой и гибкой системы, которую можно подстроить под различные задачи, — объяснил Бенджамин Вайнберг, первый автор работы и аспирант в лаборатории Вонга. – С BLADE в клетки млекопитающих можно вводить любые комбинации вычислений».

Статья описывает более 100 примеров схем, успешно созданных с помощью платформы. Список включал сложные цепи со сложными функциями, иллюстрирующие возможности системы. Схемы дизайна были загружены в онлайн-хранилище для свободного доступа других исследователей.

«До BLADE на создание любого такого контура уходило несколько лет. Затем следовал длительный период проб и ошибок, необходимый для настройки схемы, — отметил Вонг. – Схема, изготовленная с помощью этой платформы, заработала с первой попытки».

0 комментариев